1﹒柳氮磺胺吡啶
在长期治疗中已经证实了其价值，能够控制肠道病变，又可以抑制关节炎的发展，是本组疾病的首选用药。该药显示出可抑制NF‐κB的功能，因此能极好的影响促炎症因子的表达。针对

1﹒柳氮磺胺吡啶
在长期治疗中已经证实了其价值，能够控制肠道病变，又可以抑制关节炎的发展，是本组疾病的首选用药。该药显示出可抑制NF‐κB的功能，因此能极好的影响促炎症因子的表达。针对肠道炎症的使用剂量为3～6g／d，分3次服用，而用于关节炎的治疗剂量相对较小，2～3g／d，分2次服用。与之相似的药物有5‐氨基水杨酸。
2﹒抗胆碱能药物
如苯乙哌啶（易蒙停）或可待因有助于缓解腹痛、腹泻症状。
3﹒广谱抗生素
对于克罗恩病患者，以及累及大肠或引起肛周脓肿或有瘘管、中毒性巨结肠时需要使用广谱抗生素，灭滴灵最为多用。
4﹒糖皮质激素
对于中重度炎性肠病患者为控制肠道病变时才全身使用。其中泼尼松最为常用，1～2mg／（kg·d），病情控制后逐渐减量。
5﹒免疫抑制剂
为减少糖皮质激素的用量和控制病情，硫唑嘌呤和甲氨蝶呤被广泛应用。使用剂量为硫唑嘌呤50mg，每日1～2次；甲氨蝶呤7.5～15mg，每周1次。其他药物如金制剂、青霉胺及抗疟药等。
6﹒生物制剂
新近出现的TNF‐α抑制剂infliximab，可以使克罗恩病患者症状出现戏剧性的缓解，并使肠道损害长期痊愈。而对溃疡性结肠炎却无此作用，这也许能解释其不同的发病机制。一种被称为ISIS2302的细胞间粘附分子反义寡核苷酸在克罗恩病的治疗中显示出广阔的前景。