１.药物治疗
目前有临床应用价值的药物较多，但以异烟肼、链霉素、对氨水杨酸的疗效较好，毒性较小，被称为第一线药物，其他如氨硫脲、吡嗪酰胺、卡那霉素、环丝氨酸紫霉素等，这些药物效果，不及第一线药物，毒性亦较大，仅在结核菌对第一线药物产生抗药性时方始采用，故称为第二线药物。利福平、乙胺丁醇系较新的药物，由于其疗效较高，毒性较小，近年来已倾向于取代对氨水杨酸而列为第一线药物。
２.手术治疗
旨在去除不可修复的破坏病灶，解除梗阻，抢救肾功能。基本原则是：无泌尿系、男性生殖器以外的活动性结核灶；手术前必须至少抗结核2周以上，术后仍需要继续完成治疗方案。挛缩膀胱的手术治疗：手术前与结核性炎症刺激引起的膀胱痉挛鉴别。经过3-6个月抗结核治疗炎症消退容量恢复者，多为膀胱痉挛，无需手术；若无好转，则为膀胱挛缩。手术方式有：肠膀胱扩大术、尿流改道术等。
