起病较缓慢。颅脑棘球蚴大多见于大脑中动脉分布区，如额顶部。包虫囊肿生长到一定程度时会出现颅内压增高的症状，如头痛、呕吐、视物模糊；以及颅内占位症状，如一侧肢体进行性瘫痪、一侧面瘫等。癫发作也较常见，有的为大发作，有的为局灶性发作。位于其少见部位的包虫囊肿，如小脑、脑底、脑室内等处，亦可出现相应的症状和体征。脊髓包虫病极罕见，国内外有少数报道。X线颅骨平片可见到局部颅骨变薄，儿童可有颅缝分离。脑血管造影能见到围绕包虫囊肿的血管移位、变直或环绕成球形。脑包虫病的CT表现很有特殊性，不仅能准确定位，结合病史还能作出定性诊断，有助于选择表浅的位置进行手术，以避免或减少囊壁破裂囊液外溢所致的过敏反应。原发性包虫表现为脑内边界清楚的类圆形巨大囊性病灶，密度相当或略高于脑脊液，以顶叶与额叶最常见。有明显占位效应，周边通常无水肿。增强检查时囊肿与囊壁一般均无强化。若囊壁有钙化则呈现完整或不完整的环状高密度影，若囊壁周围有炎症反应时，也可出现环状强化。继发性脑包虫为多发类圆形囊状灶，较小，但周围有低密度水肿区，有互相融合的倾向。包虫阻塞脑脊液循环通路时，可见脑室扩大，脑积水。脑包虫病MRI所表现为一大的脑内囊肿，囊内容物在T1、T2加权像上和脑脊液一样，亦可显示子囊和头节，加权像上呈高信号表现，但显示囊壁钙化不如CT敏感。
头痛、恶心、呕吐、视物不清，视乳头水肿、癫痫发作。这些临床表现主要是慢性颅内压增高所致。病程常是缓慢发展的，一般当脑部症状出现时，脑包虫的囊肿体积已经较大。根据包虫囊肿在脑部的位置，可以出现一些脑局灶性症状，如局限性癫痫、轻偏瘫、失语、偏身感觉障碍等。脑包虫患者常有身体其他部位的包虫存在，如肝脏棘球幼病、肝脏肿大、肺棘球幼病、肺部有球形病变等。
血液化验检查，常见嗜酸性粒细胞增多；包虫皮内试验、补体结合试验阳性；头颅CT显示边界清楚的圆形或类圆形囊肿，造影剂增强可有轻度强化，囊肿周围有中等度水肿带。根据囊肿没有明显边缘增强，可与脑脓肿鉴别，根据囊肿没有实质部分，可与脑肿瘤鉴别。
