包囊被吞食后进入小肠下段，滋养体脱囊逸出，随粪便下降，寄居于盲肠、结肠、直肠等部营共居生活，以肠腔内细菌及浅表上皮细胞为食。在适宜的条件下，滋养体侵袭肠粘膜，造成溃疡，到一定范围和程度时，酿成痢疾。
1﹒基本病变 ①受阿米巴原虫分泌的酶的作用，组织发生溶解性坏死，周围组织炎症反应较轻。②坏死病变周围的组织中可检见阿米巴大滋养体（诊断依据）：圆形，直径10～40μm，核小而圆、可见核仁，胞质丰富，常见空泡和吞噬的红细胞。
2﹒肠阿米巴病（阿米巴痢疾）
（1）肉眼病变：①病变依次多见于盲肠、升结肠、直肠、乙状结肠、阑尾、回肠末段；重症累及全部结肠。②肠黏膜溃疡常为多个，自针尖大至直径3～4cm，圆形或不规则形，溃疡口小而底大（烧瓶形），溃疡底为灰暗色的坏死物。溃疡之间的黏膜外观正常，但有时坏死病变在黏膜下穿凿潜行，互相沟通，表面黏膜大片坏死脱落。③偶见深溃疡穿孔。④慢性期，溃疡、肉芽组织和瘢痕组织并存，肠壁增厚，可见黏膜息肉，偶见肉芽组织过度增生成瘤块状（阿米巴瘤）。
（2）光镜病变：①急性病变早期为黏膜小脓肿，后即扩大为肠黏膜及黏膜下层（有时累及肌层）的液化坏死和潜行性溃疡形成。溃疡底部组织水肿，少量中性粒细胞、淋巴细胞和巨噬细胞浸润。如合并细菌感染则急性炎症反应重，坏死广泛。②溃疡周边肉芽组织内或肠壁血管、淋巴管中可见阿米巴滋养体。③慢性期病变多样，坏死、溃疡、肉芽及瘢痕组织、黏膜炎性息肉等混合存在。
3﹒肝阿米巴病
（1）肉眼病变：①单个或多个大小不一的脓肿，80%在肝右叶。②脓肿不规则形，内容物稀稠不定、棕褐色果酱样（巧克力脓肿），内壁呈棉絮状。③慢性脓肿周围有纤维性包膜。
（2）光镜病变：①早期肝内门静脉分支呈血管炎及血管周围炎，小静脉栓塞，肝组织坏死。②脓肿壁内层由溶解坏死的肝组织、血细胞和阿米巴滋养体混合组成，可见残存的汇管区和血管轮廓，如无合并感染则周围组织非化脓性炎细胞浸润，几乎不见中性粒细胞。③脓肿周围纤维组织增生。
4﹒肺阿米巴病 ①多由阿米巴肝脓肿直接穿破而来，位于右下肺叶的单发或多发脓肿。少数由淋巴、血行播散而来。②易穿破支气管壁，空洞形成及合并细菌性化脓性炎。
5﹒脑及脑膜阿米巴病 参见第五十五章第三节（神经系统感染性疾病）。
6﹒皮肤阿米巴病 继发于肠阿米巴病。肛周深部脓肿，可形成溃疡（圆形或不规则形，数厘米至十余厘米）。
