１.常规检查
白细胞总数及中性粒细胞增多，红细胞与血红蛋白减少则因出血程度而异，血小板可减少，肠炎型者可有血样或黏液血便。
２.细菌的分离和鉴别
取血，脓，痰，脑脊液，淋巴结穿刺液等材料送检，一般检查程序包括显微镜检查，培养，鼠疫噬菌体裂解试验和动物实验，简称四步试验，以上四步均获阳性结果可确诊鼠疫。
３.血清学检查
①荧光抗体染色镜检(IFA)，具有快速，敏感度及特异性较高的优点，但有假阳性或假阴性。②间接血凝反应(IHA)，是将鼠疫特异性抗原(或抗体)致敏的红细胞与被检材料混合，用于检查和测定鼠疫抗体(或抗原)，是一种快速，敏感，特异性高的血清学诊断方法，不仅可检查活菌和死菌，也可检查可溶性抗原以及污染，腐败的材料，70年代于我国得到普遍推广，是目前行之有效的快速诊断方法之一。③放射免疫沉淀试验(RIP)，敏感，高度特异，不仅是目前鼠疫监测，查源较为理想的方法之一，特别是轻型和不典型病例的追索诊断，作为补充IHA的不足，具有一定的实用价值。④葡萄球菌A蛋白的血凝改进方法(SPA-IHA)，比间接血凝的检出率高，方法更简便，适于野外基础实验使用。
４.聚合酶链反应(PCR)检测
可以在几小时内作出诊断，是一种快速和高度特异的方法，对鼠疫监测，临床早期诊断及分子流行病学调查有重要意义。
５.其他的检测方法
有ELISA法及放射免疫法等。
轻型病例需与急性淋巴结炎、恙虫病、钩端螺旋体病、兔热病等区别，均有赖于病原学检查。
