AIS的治疗一般包括激素治疗和手术治疗两方面。激素帮助患者在青春期时性征的发育，手术用于改变生殖器的外观和功能。大多数完全型雄激素不敏感综合征患者被当做女性抚养成人，而大多数部分雄激素不敏感综合征被当做第三性别抚养，一般由家长决定治疗后成为哪种性别，也可以求助专家的意见。

对于AIS患者，更重要的是心理治疗。不仅患者需要心理治疗，患者家属也应接受心理辅导。患者幼时可能不需要特殊心理疏导，但是随着年龄的增长，心理治疗愈显重要。AIS患者可能会患有性别认同障碍和性别焦虑。由于大多数AIS儿童的性别是由家长选择的，他们长大后容易有性别认同障碍；少数情况下，一些成人或者儿童随着年龄增长发现自己性别与自我认同不一样，他们通常想要变成另一种性别，这称为性别焦虑症。