黑棘皮症的治疗主要是针对病因进行治疗，当原发疾病得到控制时，通常能够治愈或显著改善皮肤的外观。

推荐的治疗方法如下：

（1）减轻体重，改变饮食结构，合理使用降糖药物，减少血液中的胰岛素水平。

（2）针对库欣综合征、多囊卵巢综合症及甲状腺机能减退的患者，服用相应药物调整机体激素水平。

（3）如果是癌症患者，则尝试手术、化学疗法或者放射疗法进行原发疾病治疗。

（4）没有特定的疗法可以祛除黑斑，皮肤科医生可以根据病情推荐使用能改善皮肤外观的乳膏。

大多数情况下，黑棘皮症无害，并不是什么严重的临床症状。皮肤黑斑通常会随着潜在疾病的治愈而消失。如果是遗传自父母的，皮肤黑斑范围可能会逐渐变大，然后停止，或者最终自行消失。若是恶性黑棘皮症，就极有可能罹患内脏肿瘤，就是非常严重的情况了。如果治愈了肿瘤，则皮肤症状会消失，但很不幸的是导致黑棘皮症的肿瘤类型扩散速度一般很快，几乎不可能治愈。