临床起病缓慢，长期低热，腹痛多在右下腹部，常伴有腹泻，大便不规律或腹泻便秘交替，常在清晨排便，大便半成形或水样，乏力，体重下降，右下腹触痛，或可触及包块，少数患者可有肠梗阻、腹膜炎等表现。
患者诉述上腹、脐周或右下腹隐痛，阵发性绞痛，常在进食后加重，排气排便后有所减轻。排便次数增多，大便不成形，有时为水样泻，很少有血便，但大便潜血可以阳性。有的患者则以便秘为主，或便秘腹泻交替出现。多数患者合并有活动性肺结核，可伴有低热、盗汗、乏力、消瘦、食欲缺乏等全身症状。其次如恶心、呕吐也较常见。肠腔有狭窄时，可出现不完全性肠梗阻症状，如出现阵发性绞痛并比以前剧烈，还可见到有明显的肠蠕动波。
腹部体检：早期可能只有右下腹压痛。后期出现部分肠梗阻后，可见有肠蠕动波、肠鸣者亢进，右下腹可触及较硬韧的压痛性包块，并较固定。
血常规示贫血、白细胞不高，血沉增快。胸部X线检查，肺内有活动性结核或陈旧性结核病灶。
钡餐造影检查可见小肠排空过速。回盲部有激惹现象，钡剂不易充盈，造影钡影残缺，有时可见到持续肠痉挛。晚期可见盲肠部不规则充盈缺损、盲肠变形、升结肠缩短，近端肠管扩张。
