一、西医病因病理
附睾结核的原发灶常在肺、肠道、淋巴腺、扁桃体、肾脏、骨骼等部位，常通过尿路及血行感染，以尿路感染较为常见。
1﹒尿路感染
结核杆菌先经血行侵犯泌尿系而发生肾结核。从肾脏下行至尿道，再经前列腺尿道段的前列腺导管开口逆行侵犯前列腺、精囊，沿输精管蔓延至附睾尾部及睾丸。
2﹒血行感染
结核杆菌经腹主动脉，穿出腹股沟管内环，随精索内动脉进入阴囊直至附睾头部引起感染。
主要病变为干酪样变和纤维化，结核侵犯输精管时，管壁增厚，输精管变硬变粗呈串珠状。病变可沿输精管蔓延到附睾尾，然后波及整个附睾和睾丸。镜下早期病变可见附睾小管内含有脱落的上皮细胞，白细胞及大量的结核杆菌，继之出现小管坏死，形成肉芽肿、干酪样变及纤维化。偶可于附睾内见到精子肉芽肿。血行播散时，病变先位于附睾间质内，可见多数粟样微小的肉芽肿，然后侵犯附睾管，输精管多无明显改变。附睾的干酪样变很快蔓延到附睾之外，与阴囊粘连，形成寒性脓肿，破溃流脓，经久不愈。
目前附睾结核与生殖器其他器官结核、泌尿系结核的关系论点不一致。大多数学者认为生殖器官的结核与肾结核的关系密切。两者合并出现率可达80～90%。也有学者认为附睾结核可独立存在，不与生殖系结核伴随，尤其是血行感染者，特别是位于附睾头部的病变。
二、中医病因病机
中医学认为，本病之起，总由痰湿为患。发病阶段不同，表现为不同的证候。初期多为肝肾不足，阳虚痰凝，全身症状多不明显；中期化脓，则表现为阴虚有热；后期往往兼有气血不足。正如《万病回春·结核》 云：“结核，火气热甚则郁结，核硬如果中核也。……结核者，风痰、郁结也，又云火因痰注而不散也。”
1﹒肝肾亏虚
由于素体肝肾不足，脉络空虚，浊痰乘虚下注，侵袭肝肾经脉，结聚于肾子，发为本病。痰湿为阴邪，寒盛伤阳，湿性黏滞，故往往经久不愈。
2﹒阴虚内热
素体阴虚，虚火内生而上炎，灼津为痰，阻于经络，痰热互结，流于肾子致成此病。
3﹒阳虚痰凝
素体阳虚，不能化水，痰湿内生，流痰循经，结为痰核，留于肾子。
4﹒气血亏虚
久病气血两虚，痰液结聚，痰浊由阴转阳，化热，热胜肉腐为脓或漏，而成此病。