１.继发性胆总管结石
形状，大小，性状基本上与同存的胆囊结石相同或相似，数量多少不一，可为单发或多发，若胆囊内多发结石的直径较小，并有胆囊管明显扩张者，结石可以大量进入胆总管，肝总管或左右肝管。
２.原发性胆总管结石
是发生在胆总管的原发性胆管结石，病因和形成机制尚未完全明了，目前研究结果认为这种结石的生成与胆道感染，胆汁淤滞，胆道寄生虫病有密切关系，结石外观多呈棕黑色，质软，易碎，形状各异，大小及数目不一，有的状如细沙或不成形的泥样，故有“泥沙样结石”之称，这种结石的组成是以胆红素钙为主的色素性结石，经分析其主要成分为胆红素，胆绿素和少量胆固醇以及钙，钠，钾，磷，镁等矿物质和多种微量元素，在矿物质中以钙离子的含量最高并易与胆红素结合成胆红素钙，此外尚有多种蛋白质及黏蛋白构成网状支架，有的在显微镜下可见寄生虫的壳皮，虫卵和细菌聚集等。
在胆道感染的细菌中主要是大肠埃希菌，可产生大量葡萄糖醛酸酶，分解结合胆红素，使胆汁中游离胆红素增多，与钙结合，形成胆红素钙，产生沉淀。经糖蛋白的作用使形成结石，因胆红素沉淀后，需在糖蛋白等黏液性物质存在时，才能凝聚在一起形成结石。糖蛋白既能为胆红素钙提供网状支架，又能将胆红素包裹，从而阻碍胆红素钙沉淀复溶。
胆管内因虫体和虫卵可造成胆汁淤滞在胆道感染时，糖蛋白浓度升高，使胆汁表面黏度增高，胆汁流动缓慢；细菌可引起胆管上皮水肿、糜烂、纤维化造成胆管狭窄，使胆汁淤滞。这些为结石的形成提供了外部动能。
肝外胆管的基本病理变化是胆管梗阻和胆管炎：由于结石阻塞、胆汁淤积造成胆管梗阻，远端胆管扩张，管壁变厚和胶原纤维增生。一般梗阻多为不完全性或间歇性。胆管小结石常可嵌顿于壶腹部造成急性完全性胆道梗阻或胆汁淤积性黄疸。胆道梗阻必然会导致感染而致急性胆管炎，胆汁呈脓性、胆管黏膜充血水肿、溃疡和黏膜上皮脱落等。常见的致病菌为大肠埃希菌、肠球菌和厌氧菌。如结石嵌顿在壶腹部脓性胆汁逆流入胰管可引起急性胰腺炎，感染上行可致整个胆道系统（胆囊、肝内胆管甚至肝脏）炎症或肝脓肿。肝外胆管结石全身性病理变化是感染、反流性黄疸、中毒症状和休克。
