病原菌为人型和牛型结核分枝杆菌。由原发病灶如肺、骨、关节、淋巴结等处经血行或淋巴途径进入肾脏，并可蔓延至输尿管、膀胱、前列腺、附睾等处。
肾结核是全身结核的一部分，绝大多数继发于肺结核，经血行播散感染肾脏是主要途径，此外尚可因尿路、淋巴管或肾脏邻近组织结核直接蔓延所致。临床上，肾结核85%为单侧性，而9.8%为双侧性。
肾结核早期为发生于皮质内的多发局灶性结核结节，逐渐扩大融合，并侵犯髓质和肾乳头，结核结节融合及中心坏死、干酪样变，并破溃进入肾盂，形成空洞，并可进一步经肾内淋巴、血行及直接蔓延形成多个空洞；肾盏颈部粘膜的水肿糜烂和纤维化使肾盏梗阻性扩张积脓；高度纤维化是肾结核的另一病理特点，纤维化发生于血管周围可引起肾皮质萎缩（obstructive atrophy of the cortex），纤维化可使肾盂及输尿管壁增厚和肾盂扩张；只有在少数情况下，肾皮质内聚合的肉芽肿才形成较大的结核瘤。肾结核常合并肾内多发斑点钙化，晚期可破溃入肾周引起肾周脓肿。膀胱结核继发于肾结核，主要使膀胱挛缩和膀胱壁输尿管开口狭窄。
主要临床表现：多见于20～40岁，男性多于女性，主要症状为尿频、尿急、尿痛，其次是血尿、脓尿及全身中毒症状。尿沉渣涂片找到抗酸杆菌有重要的诊断意义。
