纤维肌痛综合征的原因不明，但患者可有先前的躯体或精神创伤史。纤维肌痛综合征最突出的症状是全身弥漫性疼痛，持续在3个月以上，同时会合并一些其他临床表现，常见的包括睡眠障碍、躯体僵硬感、疲劳、认知功能障碍

纤维肌痛综合征的原因不明，但患者可有先前的躯体或精神创伤史。纤维肌痛综合征最突出的症状是全身弥漫性疼痛，持续在3个月以上，同时会合并一些其他临床表现，常见的包括睡眠障碍、躯体僵硬感、疲劳、认知功能障碍等。纤维肌痛综合征很难治疗，目前还属于不能治愈的慢性疼痛性疾病。
1.中枢神经敏感化中枢神经敏感化是引起纤维肌痛综合征的最主要原因之一。长期的慢性疼痛会导致“中枢致敏”，表现在患者的脑脊液中血清素（5-HT）和P物质是升高的，另外，功能核磁共振成像技术还显示纤维肌痛患者大脑中与疼痛相关的区域功能活动是增强的。
2.免疫紊乱一些研究报道患者血清中出现抗甲状腺抗体，一些患者血清中的白介素（IL）-1、白介素-6（IL-6）和肿瘤坏死因子水平是升高的。
3.感染有人认为FS与感染有关，尤其是EB病毒、细小病毒、Burgdorferi螺旋体感染。4.遗传纤维肌痛患者的一级亲属患病率明显增加，提示遗传在发病中起一定的作用。