慢性便秘有功能性和器质性病因。器质性病因可以由胃肠道疾病、累及消化道的系统性疾病如糖尿病、硬皮病、神经系统疾病等引起，许多药物亦可以引起便秘。
１.直肠、肛门病变直肠脱垂、痔病、直肠前膨出、耻骨直肠肌肥厚、耻直分离、盆底病等。
２.内分泌或代谢性疾病如糖尿病肠病、甲状腺功能低下、甲状旁腺疾病等。
３.神经系统疾病如中枢性脑部疾患、脑卒中、多发硬化、脊髓损伤以及周围神经病变。
４.肠管平滑肌或神经元性病变。
５.结肠神经肌肉病变假性肠梗阻、先天性巨结肠、巨直肠等。
６.精神及心理障碍。
７.药物性因素含铝或钙的抗酸剂、铁剂、阿片类、抗抑郁剂、抗帕金森病药、钙通道拮抗剂、利尿剂以及抗组胺药等。
８.其他运动少、特殊职业、或曾接受腹部或骨盆腔手术后，服用特殊药物之患者。
