功能性功能性便秘病因尚不明确，其发生与多种因素有关，包括：
（1）进食量少或食物缺乏纤维素或水分不足，对结肠运动的刺激减少。
（2）因工作紧张、生活节奏过快、工作性质和时间变化、精神因素等干扰了正常的排便习惯。
（3）结肠运动功能紊乱所致，常见于肠易激综合征，系由结肠及乙状结肠痉挛引起，除便秘外同时具有腹痛或腹胀，部分病人可表现为便秘与腹泻交替。
（4）腹肌及盆腔肌张力不足，排便推动力不足，难于将粪便排出体外。
（5）滥用泻药，形成药物依赖，造成便秘。
（6）老年体弱、活动过少、肠痉挛导致排便困难，或由于结肠冗长所致。
降结肠以下肠管的自主神经支配：
副交感神经：节前纤维起自第2 至第4 骶髓的侧角，经第2、3、4 骶神经和盆内脏神经以及盆神经丛，分布于降结肠、乙状结肠、直肠和膀胱等器官内的神经节，其节后纤维分布于上述各器官。作用为加强结肠和直肠的蠕动，抑制肛门内括约肌收缩。
交感神经：节前纤维发自上部腰髓侧角（主要是第1、2 腰髓），路径相应腰神经的白交通支。穿过腰交感神经节和腹主动脉处，止于肠系膜下神经节或（上）腹下丛中散在的小神经节。节后纤维经（上）腹下丛、腹下神经和盆神经丛而分布至降结肠、直肠和膀胱的平滑肌。作用为抑制结肠和直肠的蠕动，使肛门内括约肌收缩。引起便秘的原因颇多，主要有结肠性和直肠性便秘两类。原因有以下几种：
1﹒排便动力的缺乏
排便的动力，主要依赖膈肌、腹肌、提肛肌与肠壁平滑肌，由于各种原因造成上述四种肌肉的衰弱，均可引起便秘。
2﹒肠道所受刺激不足，
肠黏膜应激力减弱，肠内容物运进受阻以及各种原因引起排便反射消失，也均可引起便秘。
3﹒直肠肛门疾患，盆腔、腹腔区大肿瘤及腹水的压迫等
。
4﹒我们所见到的便秘是由于颈椎病或腰骶疾病所引起的便秘。
是由于脊柱小关节的错位或增生骨刺，刺激或压迫了交感神经，或造成脑干、丘脑下部及高位脊髓供血不足，而抑制副交感神经系统，使分布在肠壁的胸、腰支交感神经的作用亢进，胃肠蠕动减弱和分泌减少产生便秘。
