锥虫病多有长期不规则发热、浅表淋巴结肿大、头痛、反应迟钝、嗜睡、昏睡和昏迷等临床表现。冈比亚锥虫病一般持续半年至数年，最长达8年；罗德西亚锥虫病通常不超过几个月。临床病程可分为三期：
1﹒初期
感染性采采蝇叮咬5～15日后，局部皮肤常出现炎症反应，直径可达2～10cm，称为锥虫性下疳。
2﹒血液期（锥虫血症期）
采采蝇叮咬后15日左右，锥虫大量进入血液循环和淋巴系统繁殖，引起血液和淋巴管周围炎，出现发热、剧烈头痛、神经痛、淋巴结肿大、关节痛、食欲缺乏和失眠等，以及皮肤痛痒、红斑皮疹和水肿，颈后三角区淋巴结肿大，冈比亚锥虫病颈后淋巴结肿大较明显，形成W interbot‐tom征，淋巴结各自分离、无压痛、不化脓，早期柔软有弹性，以后变硬。
3﹒睡眠期（晚期）
以神经系统症状为主，反应迟钝、懒言少语、唇舌颤动、肌肉震颤、步态不稳、妄想、狂躁，以及头痛、头晕、呕吐、脑膜刺激征等，可出现意识模糊、嗜睡和昏睡，以至昏迷和死亡。
肝脾肿大;锥虫性“下疳”;白晕;关节疼痛;瘙痒;结节
一、症状
1. 非洲锥虫病
本病初期通常无皮疹表现，有时可于叮咬处皮肤红，肿，压痛，形成结节，可有白晕，持续数天。2周后开始发热、淋巴结炎、头痛、关节痛、出皮疹等全身症状，瘙痒明显，眼睑及手足等可有短暂性水肿，伴疼痛。
体征有意识障碍、性格和举止变异、狂躁、指端、舌尖震额、手舞足蹈、共济失调、痉挛、深部感觉过敏及出现异常反射。
如未经治疗病后1年，以脑膜脑炎为主的中枢神经系统受累，面部表情迟钝为晚期锥虫病较早的特征，无目的搔痒动作，出现木僵和典型的白天睡眠状态，严重者可在吃饭或走路时，突然深度昏睡而倒下，甚至倒卧时仍保持坐立状态。可导致死亡。
冈比亚锥虫病与罗得西亚锥虫病的症状元明显区别，但前者的临床过程比较缓慢，中枢神经受损症状可在感染后数月乃至数年发生;后者发病急骤，严重感染的病例于2—4周内出现症状。冈比亚锥虫病要经过数月乃至数年才发生晚期睡眠症状;罗得西亚锥虫病的晚期中枢神经损害表现为中毒性脑病。
2. 美洲锥虫病
急性期可出现一过性荨麻疹，眼结膜常为入侵门户，出现一侧眼睑水肿，结膜炎，泪腺炎，有Romana征(即结膜炎、上下眼睑浮肿与同侧耳前淋巴结炎)。感染后2～3周，部分出现全身症状，如发热、肌痛、局部肿痛、肝脾肿大。全身性淋巴结肿大。
体征有失语、截瘫、双侧瘫痪和痉挛性瘫痪等。
慢性期则以心肌炎、心脏扩大、食道或结肠扩张为主要特征，脑部损害主要为脑膜脑炎。
二、诊断
根据流行病学资料、血清学检查以及临床表现综合考虑做出诊断，主要标准如下(在非流行地区，应更加严格执行该标准)：
1.曾在流行地区居住过。
2. 发热、头痛、关节痛、眼睑水肿等临床表现。
3. 锥虫的血清学试验阳性。
4. 血片、淋巴结穿刺液或脑脊液中找到锥虫。冈比亚锥虫病最常穿刺部位是颈后三角淋巴结;罗得西亚锥虫病宜在发热时采集外周血液;枯氏锥虫病如血片未见锥虫，可取血接种豚鼠进行培养，约在2—4周后，于豚鼠血中可查见锥虫。
