１.急性型
多于吸入较大量嗜热放线菌孢子后4～8小时内发病，起病急骤，主要表现为畏寒、高热、多汗、全身不适、食欲缺乏、恶心、头痛，且伴胸闷、气短、干咳或仅少量黏液痰，极易误诊为“感冒”，但上呼吸道症状并不明显。体检可见呼吸急促，双下肺可能闻及少量湿音和捻发音，偶闻哮鸣音，心率加快等；胸部X线检查可见肺纹理增重，并出现散在边缘模糊点片状阴影，严重者可以融合，并遍及各个肺区。另可见白细胞（主要是中性粒细胞，而非嗜酸性粒细胞）、ESR、C反应蛋白及免疫球蛋白水平升高，但这些指标并不具诊断特异性，仅有参考价值。
约有10%的患者可出现哮喘样发作、皮肤瘙痒和黏膜水肿等速发型变态反应症状。如吸入病原体量较多，病人尚可很快进展为急性呼吸衰竭甚至引起猝死。
本型病例的自愈性很强，脱离抗原接触后上述症状可在一天或数天内消失，体征和胸部X线表现也可逐渐消失，预后良好，但再接触抗原时可再发病。
２.慢性型
多因长期反复大量接触此类致病性有机尘埃所致，病情长期不愈，导致病人发生不可逆性肺损伤。临床可见咳嗽、咳痰，稍活动甚至静息时出现呼吸困难，伴发绀、厌食、极度乏力、消瘦，继发感染者可有发热、多汗。体检可见两肺广泛湿音，少数可并发气胸，易误诊为“慢性支气管炎”。可见总肺活量（TL C）、用力肺活量（F VC）降低，提示存在限制性通气功能障碍，严重者还可出现阻塞性通气功能及弥散功能障碍，可引起慢性肺源性心脏病、杵状指，常可因呼吸衰竭导致死亡，死亡率接近10%。
传统上农民肺可分为急性、亚急性和慢性三型。亚急性型多为急性延迟、发展而来，症状较重，易于误诊。但由于难以界定其时间和临床表现，且很少见，一般不必列入常规分型。
急性型：当吸入大量的嗜热放线菌孢子后约4～8h内发病，起病急骤，畏寒、高热、汗多、全身不适、食欲不振、恶心、头痛、胸闷、气短、干咳或少量黏液痰。此时极易被诊断为“感冒”，但上呼吸道症状不明显。大约有10%的患者可出现哮喘样发作、皮肤瘙痒和黏膜水肿等I型(速发型)变态反应症状。体检时可见呼吸急促，甚至缺氧。双下肺可能闻及少量湿啰音和捻发音，偶闻哮鸣音，心率加快等。脱离抗原接触后上述症状可在一天或数天内消失，有自愈趋势。如再接触抗原时可再发病。
慢性型：反复接触大量抗原者病情长期不愈。临床可见咳嗽、咳痰、呼吸困难、缺氧发绀、极度乏力。继发感染者可发烧、多汗，此时极易误诊为“慢性支气管炎”。体检可有肺间质纤维化体征或两肺散在湿啰音。
急性期农民肺诊断：①接触嗜热放线菌孢子后数小时内发病是其特征(但多误认为系“感冒”)，如有典型的症状、体征反复发作(可认为是自然激发试验)，即可诊断，必要时行辅助检查;②相应的X线胸片表现;③肺功能检查;④血清免疫学检查特异抗体阳性，特别是特异的免疫复合物阳性更有诊断价值。
慢性型患者常因症状迁延不愈，在其急性发作时临床表现又不典型而误诊。故必要时应行血清免疫学检查，甚至行肺活组织检查，结合临床综合判断。此时胸片上的改变已难消失，肺功能减退也明显，诊断不太困难。
