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由于肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿。常见的致病菌有大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌和绿脓杆菌，偶有厌氧性细菌和结核杆菌，常是多种病菌混合感染。肛门周围皮下脓肿最常
由于肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿。常见的致病菌有大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌和绿脓杆菌，偶有厌氧性细菌和结核杆菌，常是多种病菌混合感染。肛门周围皮下脓肿最常见，多由肛腺感染经外括约肌皮下部向外或直接向外扩散而成。
绝大部分直肠肛管周围脓肿是由肛腺感染引起。肛腺多位于内外括约肌之间。腹泻、便秘时易引发肛腺发炎，向上可达直肠周围疏松结缔组织，形成高位肌间脓肿或骨盆直肠间隙脓肿；向下达肛周皮下，形成肛周脓肿；向外穿过外括约肌，形成坐骨肛管间隙脓肿；向后可形成肛管后间隙脓肿或直肠后间隙脓肿。以肛提肌为界，将直肠肛管周围脓肿分为肛提肌上部脓肿和肛提肌下部脓肿。
