1.结膜细胞学结膜刮片
有助于变应性眼病的诊断，在结膜刮片的Giemsa染色（吉姆萨染色）如发现嗜酸性粒细胞或嗜酸性颗粒，将提示局部有变应性过程发生。结膜活检组织在电镜下发现有肥大细胞、嗜碱性粒细胞、嗜酸性粒细胞和（或）嗜酸性粒细胞颗粒，也具有相同的临床价值，利用电镜技术可以对肥大细胞及其颗粒进行鉴定和计数。
2.泪液组成的改变
具有重要的临床意义，泪液内嗜酸性粒细胞、嗜中性粒细胞或淋巴细胞数量增加，提示存在变应性状态。春季角膜结膜炎患者的血清和泪液中IgE的水平高于正常。
春季角膜结膜炎应与其他变应性结膜病相鉴别。严重的春季角膜结膜炎患者具有典型的体征：睑结膜铺路石样乳头增生、盾形溃疡、Horner-Trantas点以及其他征象。然而对于轻型病例，确诊比较困难，常需要借助实验室检查。
1.特应性角结膜炎 在早期，
两种疾病常易发生混淆。在流行病学上，特应性角结膜炎多发于十几岁到中年;多为常年性，比春季角膜结膜炎病程长。从外部观察，特应性角结膜炎患者的眼睑常有慢性眼睑炎和湿疹。同春季角膜结膜炎不同，特应性角结膜炎常引起结膜瘢痕、上皮下浸润和下穹隆缩窄。其他的症状和体征也有助于两者之间的鉴别：特应性角结膜炎主要影响下睑结膜，有小乳头;特应性角结膜炎的角膜新生血管化通常位于深层;特应性角结膜炎的分泌物多为水样，而春季角膜结膜炎的分泌物多为黏稠性;在特应性角结膜炎很难发现有Homer-Trantas点;春季角膜结膜炎的结膜刮片很少发现有嗜酸性颗粒。
2.枯草热性结膜炎
又称季节变应性结膜炎，是临床常见的疾病。与抗原接触后迅速发病。主要表现为结膜充血、结膜水肿和偶发眼睑水肿。与春季角膜结膜炎不同，季节变应性结膜炎患者常伴有变应性鼻炎或鼻窦炎。季节变应性结膜炎很难观察到角膜的改变。
3.巨乳头结膜炎
主要与配戴接触镜有关，其他的刺激因素还有配戴义眼、埋藏缝线暴露。其上睑结膜的乳头反应和黏液的产生非常类似春季角膜结膜炎。当去除刺激因素后，巨乳头结膜炎的症状和体征将明显减轻或消失。通过病史分析和仔细检查可以进行鉴别诊断。
4.接触性结膜炎
因使用药物诱发超敏反应而造成的化学性(或毒性)结膜炎也可产生类似春季角膜结膜炎的症状和体征。引起药物超敏反应的主要药物有：阿托品、局部麻醉药、抗生素、苯肾上腺素和其他药物载体。化学性结膜炎的乳头反应并不剧烈，下穹隆结膜易受累。
5.沙眼
沙眼也可引起上睑结膜和角巩膜缘上方的病理改变。然而，与春季角膜结膜炎不同，沙眼可以引起结膜瘢痕、滤泡性结膜炎和Arlt线(水平方向的上皮下纤维化)。结膜刮片无嗜酸性粒细胞存在。然而，春季角膜结膜炎有时和沙眼同时存在。
