1、药物治疗

海绵窦血栓形成需要在医院治疗。在大多数情况下，由于病情凶险，患者往往需要在重症监护病房接受治疗，以便密切监测病情变化。

抗生素是治疗海绵窦血栓形成的主要方法。在检查结果确认是否是细菌感染导致之前，就应该开始使用抗生素治疗。如果检查结果显示不是细菌感染引起，再停止抗生素治疗。大多数人将需要至少三到四周的抗生素疗程，以确保感染完全从身体清除。一般选择静脉用抗生素。当然抗生素使用时，可能会有极少数人会出现副作用。 这些副作用通常是轻微的，如腹泻，恶心等消化道症状和皮疹。

在某些情况下，患者也可能会使用肝素这种药物来帮助溶解血栓并防止血栓进一步形成。 肝素是一种抗凝药物，它可降低血液的粘稠度。使用抗凝剂治疗海绵窦血栓形成有一些不确定性，例如什么时候使用和使用多久。使用不当也有引发严重问题的风险，如出血过多。由于海绵状窦血栓形成比较罕见，难以展开研究，所以缺乏使用抗凝剂治疗的证据。然而少量研究似乎表明抗凝剂可以成为一种有效的治疗方法，而且大多数医生认为应该在适当的情况下使用。

另一种治疗药物为类固醇药物（皮质类固醇）。 皮质类固醇可以减轻机体的炎症和水肿。与抗凝治疗一样，没有证据表明皮质类固醇治疗海绵窦血栓形成的有效性。尽管如此，皮质激素的使用被认为对某些患者是有益。

2、手术引流治疗

如果海绵状窦血栓形成的症状是由于疖或鼻窦炎引起的感染而导致的，需要从感染部位排出脓液。这就需要使用针头或在手术方式来完成。

通常需要几周的抗生素治疗才能确保感染清除。但是，完全恢复需要很长时间，有的患者甚至需要几个月的住院治疗。