感染后全身反应少见，早期主要为皮肤瘙痒，皮疹，也可有低热、头昏、头痛、乏力、腰背痛以及胸部、肩髋关节痛等主诉。数月后开始出现本病特征性皮下结节。结节质硬，圆形或长形，不痛，边缘清楚，可推动，也可固定于骨膜、筋膜或皮肤。晚期患者皮肤增厚，呈苔藓化，伴色素不均，呈豹皮样。皮肤病变依次见于臂、腰、下肢和躯干，头部少见。全身表现包括体重减轻，肌肉酸痛，最常见的并发症为特征性的角膜炎、睫状体炎、青光眼、脉络膜炎和视神经萎缩，最终造成失明，发病率约为15%～20%。
淋巴结病变表现为淋巴结肿大而坚实，不痛，淋巴结内含大量微丝蚴，这是盘尾丝虫病的典型特征。眼部损害是盘尾丝虫病最严重的病损。在非洲某些地区，眼部受损者高达30%～50%，成人患“河盲症”者达5%～20%。微丝蚴可直接侵入眼眶、眼睑、结膜、角膜或经血流侵入眼内各组织。儿童、青少年感染可表现为慢性结膜炎性增生、结膜下结节、巩膜炎、进行性角膜炎及点状上皮下角膜炎等。感染多年后，眼部损害缓慢发展，大多数患者的年龄超过40岁。主要表现除角膜损伤所产生的相应症状外，严重者可出现微丝蚴侵入前房，引起虹膜睫状体炎、脉络膜炎和视神经萎缩，使患者眼失明。
