急性咽炎的反复发作是导致慢性咽炎的主要原因。
1.咽部邻近的上呼吸道病变如鼻腔、鼻窦、鼻咽部的慢性炎症，可因炎性分泌物经后鼻孔倒流至咽部刺激咽部黏膜；慢性鼻炎、鼻中隔偏曲、慢性鼻窦炎、腺样体肥大、鼾症或鼻腔鼻窦及鼻咽部占位性病变等疾病由于影响鼻腔通气，造成长期张口呼吸，引起咽部黏膜长期过度干燥而导致慢性咽炎；慢性扁桃体炎的慢性炎症可直接蔓延至咽后壁，引起慢性咽炎；口腔炎症如果不能得到及时控制，随着炎症扩散也可导致慢性咽炎。
2.气候及地域环境变化温度、湿度的变化、空气质量差、烟酒刺激、辛辣刺激性食物、粉尘、有害气体及放射性照射也是导致慢性咽炎的原因。
3.职业因素长期大量用声者如教师、歌唱者及易感体质因素亦可引起本病。
4.全身因素如贫血，消化不良，胃食管反流，心脏病（因血液循环障碍影响咽部静脉回流造成咽部局部淤血），慢性支气管炎，支气管哮喘，风湿病，肝、肾疾病等，也可引发慢性咽炎。内分泌紊乱，自主神经失调，臭鼻杆菌及类白喉杆菌的感染，维生素缺乏及免疫功能紊乱等均与萎缩性及干燥性咽炎相关。5.过敏因素吸入性过敏原（包括季节性与常年性过敏原），药物、工作环境中的化学刺激物及食物过敏原都可以引起变应性咽炎。
﹒交感神经颈上神经节的分支——咽支
1，由颈上节发出后进入咽壁，与迷走神经和舌咽神经的咽支合成咽丛。当颈部外伤、劳损及退变造成失稳，小关节错位，直接、间接刺激或压迫交感神经，而使之功能发生异常。
2﹒椎体前缘骨质增生，直接或间接刺激咽部而引起。
3﹒咽部黏膜充血，黏膜下结缔组织及淋巴组织增生，
淋巴组织常围绕黏膜之黏液腺管而增生，咽后壁呈多数颗粒状突起。腭扁桃体及舌扁桃体常发生炎症，咽壁各肌亦有肥厚变化。悬雍垂常肿厚下垂，而导致咽部不适等。
