患儿出生的时候，有的会存在唇裂、有的存在腭裂，有的两种并发。唇裂有时仅影响单侧的嘴唇，也有时会影响双侧。裂口可能是很小的凹槽，也可能很大远达鼻子的沟。腭裂小的裂口有时会藏在口腔深部，很难被发现。大的裂口可能直接贯穿整个口腔。

未经过正规治疗的唇腭裂可能会造成很多健康问题，对婴儿早期影响尤其严重。造成的问题可能包括以下方面：喂养困难，因为裂口会使嘴巴无法形成正常吸力，唇腭裂婴儿可能无法接受母乳喂养或者用普通的奶瓶喂养；听力问题，唇腭裂儿童很容易发生耳部感染和耳内积液（咽鼓管阻塞）影响正常耳内功能；牙科问题，唇腭裂会影响正常的牙齿发育，使患儿更容易罹患龋齿；发音问题，如果唇腭裂不经外科处理，后期患儿就可能发生语言发音障碍。