１.病理组织学检查
可见棘层细胞组织高度肥厚，成乳头瘤样增生，上皮脚延长，有大量核分裂象，上皮细胞出现空泡化。电镜下可见嗜碱性细胞的胞核中有病毒颗粒。可辅助明确诊断及与癌变、肛门皮肤结核等鉴别。
２.

１.病理组织学检查
可见棘层细胞组织高度肥厚，成乳头瘤样增生，上皮脚延长，有大量核分裂象，上皮细胞出现空泡化。电镜下可见嗜碱性细胞的胞核中有病毒颗粒。可辅助明确诊断及与癌变、肛门皮肤结核等鉴别。
２.醋酸白试验
以5%醋酸溶液涂于会阴及肛门周围皮肤，3～5分钟后即可在HPV感染区域出现有光泽、均匀一致、界限清楚的变白区，用放大镜观察更为明显。但局部若有炎症，也可发白而出现假阳性。
３.梅毒血清检查
尖锐湿疣为阴性，扁平湿疣则呈阳性，可供鉴别。
４.阴道内镜检查
（１）最常见为扁平疣状，多发性，表面呈白色，颗粒状。
（２）菜花样上皮增生，表面粗糙，有指状突起，表面有很多毛细血管。
（３）穗状，呈白色，表面粗糙不平。
（４）湿疣宫颈阴道炎，黏膜表面可见许多粗糙面或菜花状湿疣。
５.肛门直肠镜检查
齿线上下和直肠末端，可见淡红色乳头状或菜花状柔软赘生物，质脆，触之易出血。

扁平湿疣：为多个湿丘疹融合成片状的皮损，多见于肛周，皮损处可查到梅毒螺旋体，梅毒血清试验呈阳性反应。