由于缺乏有效的治疗措施，诊断成为应对埃博拉病毒的关键。检测实验在很大程度上取决于多重 RT-PCR 检测。抗原检测也可以一起进行，作为确诊检测。而抗体检测（例如IgM和IgG）是次要的检测方法

由于缺乏有效的治疗措施，诊断成为应对埃博拉病毒的关键。检测实验在很大程度上取决于多重 RT-PCR 检测。抗原检测也可以一起进行，作为确诊检测。而抗体检测（例如IgM和IgG）是次要的检测方法。欧盟的“欧洲移动实验室”发挥了巨大作用。第一个“移动实验室”已于2014年3月被派往几内亚的盖凯杜疫区，目前已开展约1100次检测，其中超过400次检测结果为阳性。目前全球总共发现不到两千例埃博拉出血热确诊或疑似病例，“移动实验室”在确诊病例方面作出了重要贡献。2014年8月，欧盟还将设置第二个“移动实验室”，它有可能被运往塞拉利昂。欧盟的这种“移动实验室”一直就是为应对突发疫情而设计的。其检测范围覆盖全球多种威胁巨大的病毒。埃博拉疫情使其有了发挥作用的实战机会。从实战中不断总结埃博拉病毒特点，获得最新数据，有助完善其诊断水平。而“移动”的特点，使该实验室可以奔赴许多疫区，提高发现患者的效率。

须与其他病毒性出血热相鉴别。如：
1.流行性出血热
呈急性病容，面、颊及上胸部充血、潮红，眼结膜充血。
2、登革出血热
登革出血热是一种临床综合征，其主要症状有高热、肝脾肿大、休克和出血现象，多数病人在四肢、面部、腋下和软腭见有散在性瘀点，有时融合成瘀斑。